Raphael, Michelangelo, Leonardo và Donatello đã trở lại hành động và tiếp tục những trò hề tuổi teen của họ trong cuộc phiêu lưu hài hước này làm tăng tiền cược cao hơn bao giờ hết. Rùa được đưa vào thử nghiệm khi một người lạ bí ẩn tên là Casey Jones đến từ tương lai để cảnh báo các anh em dị nhân về một cuộc xâm lược sắp xảy ra của lực lượng ngoài hành tinh nguy hiểm nhất trong thiên hà - Krang! Liệu cả đội có thể vươn lên để trở thành những anh hùng mà họ được định sẵn, hay những đứa trẻ tuổi teen của họ sẽ giỏi hơn họ? Những gì mở ra là câu chuyện phiêu lưu, cảm xúc và hoành tráng nhất từng được kể về Ninja Rùa đột biến tuổi teen.